Prestazioni di RT salivare rapida e connessa

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Aug 10, 2023

Prestazioni di RT salivare rapida e connessa

Scientific Reports volume 12, Articolo numero: 2843 (2022) Cita questo articolo 2457 Accessi 7 Citazioni 10 Dettagli metriche altmetriche Nel contesto della riapertura degli eventi sociali e del rilancio economico,

Rapporti scientifici volume 12, numero articolo: 2843 (2022) Citare questo articolo

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Nel contesto della riapertura degli eventi sociali e del rilancio economico, è ancora necessaria la sorveglianza sanitaria dell’infezione da SARS-CoV-2. Qui, abbiamo valutato le prestazioni diagnostiche di un test di amplificazione isotermica mediata da loop di trascrizione inversa rapido, privo di estrazione e collegato (RT-LAMP) sulla saliva. I tamponi nasofaringei (NP) e la saliva di 443 pazienti ambulatoriali sono stati raccolti simultaneamente e testati mediante PCR quantitativa a trascrizione inversa (RT-qPCR) come test standard di riferimento. Settantuno individui (16,0%) erano positivi alla NP e/o alla RT-qPCR salivare. La sensibilità e la specificità della RT-LAMP salivare erano rispettivamente dell'85,9% (IC 95% 77,8–94,0%) e del 99,5% (98,7–100%). Le prestazioni erano simili per i partecipanti sintomatici e asintomatici. Inoltre, sono state analizzate le varianti genetiche di SARS-CoV-2 e durante il periodo dello studio non è stata osservata alcuna mutazione dominante nella regione del primer RT-LAMP. Abbiamo dimostrato che questo test RT-LAMP sulla saliva autoraccolta è affidabile per il rilevamento della SARS-CoV-2. Questo semplice test connesso con trasferimento automatico opzionale dei risultati alle autorità sanitarie è unico e apre la strada per garantire eventi professionali e sociali nell'attuale contesto di riavvio dell'economia.

La pandemia della malattia da coronavirus 2019 (COVID-19) richiede una diagnosi rapida, accurata e scalabile per aggirare la diffusione della malattia e riaprire in sicurezza la società. La reazione a catena della polimerasi quantitativa a trascrizione inversa (RT-qPCR) e il rilevamento dell'antigene sono i principali metodi diagnostici utilizzati per la diagnosi dell'infezione da sindrome respiratoria acuta grave da coronavirus 2 (SARS-CoV-2), con RT-qPCR che è il gold standard convalidato. Questo test richiede strumentazione specializzata e costosa, personale addestrato e reagenti con fornitura limitata. RT-qPCR richiede l'estrazione dell'RNA, che rappresenta un collo di bottiglia che richiede molto tempo e normalmente restituisce i risultati 24 ore dopo la raccolta del campione.

RT-LAMP (amplificazione isotermica mediata da loop di trascrizione inversa) è una tecnologia rapida e portatile che non richiede né analisti altamente qualificati né strumenti specializzati (normalmente è necessaria solo una fonte di calore) rendendo questa tecnologia un'alternativa alla RT-qPCR.

I tamponi nasofaringei (NP) e orofaringei (OP) sono i campioni più comunemente utilizzati per la diagnosi dell’infezione da SARS-CoV-2. Il campionamento di tamponi NP e OP è invasivo, doloroso ed espone gli operatori sanitari alla contaminazione1. Al contrario, l’autocampionamento della saliva è semplice, non invasivo e particolarmente adatto per i test su bambini e anziani. Inoltre, la raccolta della saliva non richiede materiali specializzati ed esonera dall’uso di dispositivi di protezione individuale, risparmiando tempo e costi. Poiché il campionamento della saliva è ben accettato2,3, è un campione adeguato per i test di massa e domiciliari.

Allo stesso modo, SARS-CoV-2 è stato rilevato a carichi elevati nella saliva di individui sintomatici e asintomatici e ha anche dimostrato di infettare le cellule bersaglio4,5,6,7,8,9,10,11. Gli studi che hanno confrontato saliva e NPS utilizzando il test di amplificazione dell'acido nucleico (NAAT) hanno mostrato sensibilità che variano dal 69,2 al 100%5,6,8,12,13. Una recente meta-analisi ha suggerito che l’accuratezza diagnostica della NAAT sulla saliva e su NPS è simile14.

La situazione sanitaria mondiale del COVID-19 rimane eterogenea principalmente a causa delle diverse politiche, risorse e strategie di vaccinazione anti-pandemia15. Per i prossimi mesi sarà centrale la strategia di riapertura e rilancio degli eventi sociali e professionali. Oltre al monitoraggio della pandemia a medio/lungo termine, il test sulla popolazione è ancora importante poiché l’immunità vaccinale e l’immunità naturale sono imperfette e il distanziamento sociale è più flessibilizzato16. A tal fine, oltre agli approcci di sorveglianza collettiva (ad esempio i test sui virus delle acque reflue), le autorità sono alla ricerca di sistemi di test individuali con maggiore accettabilità ed efficienza da parte della popolazione. Pertanto, le specifiche ideali dei test virali individuali sono: (1) campionamento semplice e indolore per evitare qualsiasi riluttanza da parte della popolazione a eseguire test ricorrenti, (2) facile, rapido e a basso costo per renderlo utilizzabile su larga scala e in qualsiasi condizione, anche senza laboratori specializzati e competenze, (3) sensibili e specifici per garantire sicurezza e (4) essere connessi in tempo reale per consentire informazioni individuali immediate e il monitoraggio da parte delle autorità locali o nazionali17. Quest’ultimo punto è fondamentale per mettere in sicurezza gli eventi o gli impianti professionali per il ritorno alle attività. Lo sviluppo di una RT-LAMP salivare rapida che soddisfi la maggior parte di questi punti per il rilevamento della SARS-CoV-2 rappresenterebbe un passo avanti nell’implementazione di un test point-of-care per riaprire in sicurezza le economie e prevenire future epidemie.

 C) and AY.34 (major mutation 26109G > A) and the VOIs B.1.621 and its descendent lineage B.1.621.1 (26158_26161del) presented a prevalence of 6.1%, 0.3% and 0.2%, respectively, of all sequenced specimens over the world and sampled between July to October 2021 (updated on November 10th 2021)./p>